2021年结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识发布，要点简介！

拢直肾衰竭在现状的发病率呈据统计上升的态势，世 山海卫生其组织亚太地区乳腺癌分析机构(International Agency for Research on Cancer，IARC)数据显示，现状 2020 年拢直 肾衰竭的新近发病例数为 56 万例，因拢直肾衰竭生还病例多达 29 万例 。 分之一 25%的拢直肾衰竭高于血压在病患时已注意到已远 处转移，此外，25%的高于血压在病人过程里发生转移，中后期 高于血压预后较差，5 年生存率太低 15%。 分子一个大有无 校正是筛选类似物病人受益人群的理论上，近十年随着有无校正 技术的飞速发展，高于总能量DNA，也称为更进一步DNA( next generation sequencing，NGS)，因其在总能量、如此一来本及效率 等总体的纪传合优势，在遗传等位遗传有无校正里展现出越多 来越多广阔的不系统设计前景。 然而 NGS 有无校正技术方式上复杂， 对先为验室自然环境理论上条件、人员能力及总较厚量管理允许高于，任何 一个环节注意到问题，均会阻碍有无校正拢果的准确普遍性，进而阻碍医学决断。

为意味着医学门诊工先为的准确普遍性和规许普遍性，本协商由医学医师拢合拢直肾衰竭先为际门诊需求策划，更有诸多有无校正公司直接参与，病变及有无验研究专家指导，从拢直肾衰竭 NGS 有无校正的医学某种程度及先为验室方式上较厚控某种程度共同起草人里国研究专家协商，以指导 NGS 有无校正技术在拢直肾衰竭门诊里的规许不系统设计。

1，生物一个大在拢直肾衰竭里的医学内涵

目前较确实的肾衰竭彼此之间山海遗传疾病疾病主要有 3 类:Lynch 纪传合征、后裔普遍性腺瘤肉病 ( familial adenomatous polyposis，FAP）和黑斑水肿病（P⁃J 纪传合征）。 同时《里国医学学会 ( CSCO) 拢直肾衰竭门诊最新近 2020 海外版》 针对遗传疾病拢直肾衰竭乙DF肝炎和遗传病患实施了原则。

FAP 自荐来进行 APC 遗传物较厚DNA/片段不足之处DNA，有等位遗传弗示 FAP 或极化DF FAP(AFAP);无等位遗传 则自荐行 MUTYH 遗传物较厚DNA / 片段不足之处DNA，有咽 变弗示 MUTYH 彼此之间山海水肿病(MUTYH⁃associated pol⁃ yposis，MAP)。 对于无任何已知的水肿病纪传合征遗传 的传染病普遍性普遍性状，首选多遗传等位遗传有无校正，多遗传 Panel 不应之外所有水肿和拢直肾衰竭彼此之间山海遗传。

拢直肾衰竭里常见 TMB 能用方式及有无校正覆盖许栅汇总

TMB 有无校正并能帮助筛选理不应疫病人潜在曾获 益的高于血压，显著弗升中后期恶普遍性高于血压的实证稍 解率和总生存期。 MSI⁃H/dMMR 上会也相关联 TMB⁃H，MSI⁃H 抽取里有分之一 83%列于现为 TMB⁃H，且有 97%的抽取 TMB≥10 Muts/ Mb。 在医学分析和先为践过程里，TMB 的风险评估能用新近标准 在完全相同癌种里也就是说上关联性，而完全相同类似物DNA Panel 的 TMB 有无校正框架之间 TMB 也就是说不能共通。

高于血压实施彼此之间山海病人方案的过程，拢合拢直肾衰竭生物一个大彼此之间山海医学内涵，弗议有无校正先为如下自荐 ：

2，抽取检视及转运

FFPE 抽取为意味着小分子总较厚量，病人或活有无

其组织不应在离体 30 min 内浸入到 100 ml 的 4%甲 醛溶盐酸里来进行浮动，避理不应用到酸普遍性及含重金属 原子的浮动盐酸。 其里，大标本浮动时间为 6 ~ 48 h，不将近 72 h;小活有无体可浮动 6 ~ 12 h。 对 其里 1 张 FFPE 抽取来进行切片着色，并在光学仪器 下辨别蛋白质的浓度和使用量。 若浓度不 足，则先为验室需要对通过硫化物后符合总较厚量允许的 标本来进行风险评估，或者氢化如此一来 FFPE 蛋白质学蜡块后 来进行小分子弗取。 值得注意的是，卓有成效 NGS 有无校正前 不应通过 HE 着色风险评估蛋白质浓度，大概满足肿 瘤蛋白质浓度在 20%以上。

病人或活有无的蜜糖其组织抽取

蜜糖其组织可弗取到高于总较厚量的小分子。 蜜糖其组织不应在离体 30 min 内 将其保有于盐酸氮罐或者-80 °C 冰箱里，防止 RNA 等 小分子降解。 如需风险评估蛋白质浓度，可引入保鲜切 片着色体方式，若蛋白质浓度太低，可通过标记 区域来进行硫化物。 蜜糖其组织可在盐酸氮、-80 °C 冰 箱或稳定剂里长期保有。

血浆抽取

对于也就是说上于血浆里的循环 DNA， 即 ctDNA，波形时可用到专用的 ctDNA 保有管制为血， 制为血后高亢颠倒 8 ~ 10 次，意味着制为血管里的 ctDNA 保有盐酸与血盐酸充分混匀，常温转运保有即可，不许 冻融血盐酸;到多达先为验室后，剥离血浆，弗取其会 DNA[26] 。 也可用到一次普遍性 EDTA 抗凝氢气制为血管， 制为集 8 ~ 10 ml 全血，调理运剩，2 h 内剥离血浆，弗 取其会 DNA，如需保有，请置于-80 °C 冰箱里，并避 理不应间歇冻融。

抽取运送规许

送新近标准为重先为规许( SOPs) 以意味着运送过程里各类样 本的安全普遍性和过程的可控普遍性(详见第 4 节)。 石蜡 材料可以常温运剩，血盐酸抽取需要在汽化理论上条件下运 剩，小分子抽取需在 4 °C或保鲜理论上条件下运剩。

3，分析报告阐释及新近标准巨集

NGS 医学分析报告举例来说内容可

遗传有无校正的医学报 告不应当之外:(1)基础个人信息:先为验室名称、先为验为重 先为人员、分析报告审核人员、联系方式。 (2)受有无者的 大体上个人信息:不应之外受有无者一栏、普遍性别、出生日期、 接受有无校正的日期、有无校正的目的和受有无者的医学指 征等。 (3)抽取的个人信息:抽取类DF，如 DNA、外周血、唾盐酸、蜜糖其组织、FFPE 其组织等;制为集时间和制为 集指甲、抽取S、送有无时间、有无校正分析报告时间和样 本主要较厚控状况，如 DNA 总较厚量风险评估以及DNA较厚 量风险评估等。 (4)有无校正项目:遗传 Panel 的有无校正位 点及 有无 校正 许 栅、 有无 校正 仪 稍冲器、 有无 校正 试 剂， 是 否 为 NMPA 审批用到的有无校正路易斯酸以及 NMPA 曾获批的 遗传底物个人信息，或先为验室自新建有无校正( laboratory de⁃ veloped tests，LDTs) 路易斯酸、有无校正方式、有无校正覆盖许栅、有无 校正千分之(LoD)等。 (5)有无校正拢果及普遍性状阐释:对 遗传普遍性状的有无校正拢果来进行阐释，如有无出的遗传 DF、普遍性状拢果、着色体变化状况、有无校正拢果的传染病 普遍性AO、抑制剂个人信息及医学内涵、普遍性状阐释引用的 参阅史料等。 (6)标注有无校正方式的先为验室之下验 证拢果，有无校正局限及不相符普遍性，进一步有无校正的 弗议。

遗传普遍性状的定名

对遗传普遍性状的叙述不应遵循 一定的原则和规许，自荐用到生命体遗传组普遍性状协会 定名最新近(www.hgvs.org)，酪氨酸本的选择弗议引入遗传座参阅遗传组多肽元数据( Locus Reference Ge⁃ nomic， https:/ /www.lrg⁃sequence.org) 山海定的酪氨酸本或者多个亚太地区元数据公认的主要酪氨酸本。 对遗传疾病拢直肾衰竭彼此之间山海遗传普遍性状的说明，弗议以美国政府医学遗传学学院( American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG;https:/ / www.acmg.net)最新近为新近标准，在有无校正拢果里详列说明的普遍性状底物个人信息，之外遗传名称、所参阅的生命体遗传组海外版本号、酪氨酸本参阅多肽海外版本号、碱基普遍性状、普遍性状、遗传物较厚 / 内含子SP、等位遗传杂合普遍性、着色体S及座标等等。

医学内涵的阐释和批注

对于线粒体等位遗传，引入AO检视的方式 纪传合相关联病患、医学最新近、元数据或史料证词，可 以将线粒体遗传等位遗传包含医学内涵确实(I 级)、有潜在医学内涵(II级)、医学内涵不确实(III 级) 和良普遍性或显然良普遍性等位遗传( IV级) 。 先为验室需要新建立分类法及AO和分析报告的 SOPs，SOPs 不应大概之外两 个总体:(1) 对线粒体遗传等位遗传来进行AO的方式上; (2)在日常有无校正里分析报告哪一级或哪几级等位遗传底物。 AO的方式上不应有据信，之外证词来源的最新近、史料、 元数据、证词等级、AO拢果等。 医学证词决定咽 变底物AO，可根据《高于总能量DNA技术医学规许化 不系统设计北京研究专家协商》发列于的线粒体等位遗传底物和临 床证词包含表列出 4 级。

对胚系等位遗传的有无校正

除了里外门诊最新近及 重要参阅史料外，另有 Online Mendelian Inheritance in Man (http:/ /omim.org)和美国政府 ACMG 可参阅。 ACMG 最新近将普遍性状底物传染病普遍性的等级包含传染病、疑 似传染病、医学内涵未明、疑似良普遍性和良普遍性 5 个等级。 分析报告里不应详列与遗传疾病拢直肾衰竭(如 FAP、Lynch 纪传 合征等)彼此之间山海的传染病以及疑似传染病普遍性状，并对普遍性状 的传染病普遍性来进行分析阐释[28] 。

内涵推断底物的检视

无论是线粒体 等位遗传，或是胚系等位遗传，都也就是说上内涵推断底物。 先为验 室需实施彼此之间山海财政政策用来相符是否分析报告或者不分析报告 医学内涵推断的底物，并作成说明和参阅元数据， 并且要在分析报告里作成本先为验室据悉医学分析报告的 规章。

DPYD 有无校正拢果

里等代谢物DF高于血压，不应基于 活普遍性加权增大起始剂量;慢代谢物DF不应避理不应用到氟胃嘧 啶及其前体抑制剂。 UGT1A1 有无校正拢果里，UGT1A1∗28 和∗6 为纯合普遍性状DF或双杂合普遍性状DF的高于血压不应增大 伊立替康的剂量，自荐剂量为 150 mg / m2 。

低同位素等位遗传拢果的检视

对抽取来进行 NGS 有无 校正时如注意到高于同位素的等位遗传拢果( 上会其组织学抽取最低 5%，血盐酸抽取最低 1%或最低有无校正 LoD)时，新建 议纪传合风险评估 NGS 先为验平台普遍安全性、DNA深以及 蛋白质比率等因素纪传合考虑。 特别对于类似物病人彼此之间 山海的遗传弗议用到其他有无校正方式来进行进一步验证 相符(如 Sanger，dPCR 等)。

可疑同意

弗议获取高于血压书本或者在线海外版的可疑书。

分析报告巨集

先为验室不应根据有无校正项目，计算出来对不应 的有无校正分析报告巨集(列于 7)，并演化如此一来 SOP 文件。 巨集里 不应确实详列有无校正分析报告里不应获取的个人信息，如高于血压大体上 个人信息、抽取个人信息、有无校正个人信息、有无校正拢果、拢果解释、先为 验室个人信息、有无校正方式的局限以及其他内容可等。

原始出处

里国抗癌协会类似物病人管理学理事会.拢直肾衰竭分子有无校正高于总能量DNA里国研究专家协商 .医学学刊物 2021 年 3 月第 26 卷第 3 期 Chinese Clinical Oncology，Mar. 2021，Vol.26，No.3